作者 / 黃連鴻
這項研究探討了免疫細胞浸潤在肝細胞癌(HCC)中的作用及其與癌幹細胞特性的關聯。研究團隊分析了來自TCGA數據庫的141例HCC組織和21例癌旁組織樣本，發現HCC組織中的mRNA表達型幹細胞指數(mRNAsi)顯著高於癌旁組織。生存分析顯示，高mRNAsi值與較差的總體生存率顯著相關(p=0.011)。腫瘤突變負荷(TMB)分析進一步揭示，高TMB組的mRNAsi值顯著高於低TMB組，表明mRNAsi與腫瘤基因突變狀態密切相關。
通過加權基因共表達網絡分析(WGCNA)，研究團隊鑑定出10個關鍵基因，包括CDC6、DTL、FOXM1、HJURP、KIFC1、MCM2、MELK、NEK2、PRC1和TOP2A。這些基因在低免疫細胞浸潤組中呈現高表達，並主要參與細胞週期的調控。RT-qPCR驗證結果顯示，這10個基因在HCC組織中均顯著上調，且在晚期(第三期)HCC中的表達水平明顯高於早期(第一、二期)。蛋白互作網絡分析揭示這些基因之間存在緊密的功能聯繫，KEGG通路富集分析表明它們主要富集於細胞週期相關通路。
在免疫微環境分析方面，單樣本基因集富集分析(ssGSEA)將HCC樣本分為兩個亞組。高免疫浸潤組表現出更高的免疫評分和ESTIMATE評分，但間質評分無顯著差異。10個關鍵基因在低免疫浸潤組中顯著高表達，提示這些基因可能通過影響細胞週期來調節腫瘤免疫微環境。
此外，研究發現這些基因與HCC的發展進程和預後密切相關。例如，MCM2增強HCC細胞的幹細胞特性並影響索拉非尼耐藥性；CDC6表達與CD8+ T細胞、CD4+ T細胞等免疫細胞浸潤水平相關；FOXM1過表達是HCC復發和生存的重要風險因素；NEK2促進HCC轉移並與復發相關。
這項研究首次系統揭示了一組細胞週期相關基因與HCC幹細胞特性和免疫微環境的關聯，為理解HCC的發生發展機制提供了新的視角。然而，本研究仍存在一些局限性，如單中心回顧性研究可能帶來選擇偏倚，且需要進一步實驗研究闡明這些基因如何調控癌幹細胞並影響腫瘤免疫微環境。未來的研究應著重於探索這些基因在HCC治療中的潛在應用價值。
這篇論文是由謝青華醫師的指導下完成，發表於SCI雜誌International Journal of Molecular Science。
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